Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPCAMP16422 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPCAMP16422 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPCAMP16422 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms