Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ITGAVP06756 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms