Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN9O14815 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms