Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVV-1B6SEH8 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms