Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
GGTLC3B5MD39 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms