Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHST12Q9NRB3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHST12Q9NRB3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms