Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPPQ6IPU0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms