Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF2Q5BJF6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms