Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms