Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLPPQ16740 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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