Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF239Q16600 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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