Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms