Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEUP1Q05D60 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms