Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
TNP2Q05952 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.79-201ENST00000610676 290 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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TNP2Q05952 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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