Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG7P83436 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG7P83436 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COG7P83436 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms