Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PGGT1BP53609 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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