Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms