Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms