Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLR2AP24928 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms