Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCP2P22307 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCP2P22307 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms