Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TCAF1Q9Y4C2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCAF1Q9Y4C2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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