Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP8A1Q9Y2Q0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms