Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TNFSF18Q9UNG2 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms