Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LHX3Q9UBR4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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