Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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