Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CIPCQ9C0C6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CIPCQ9C0C6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CIPCQ9C0C6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CIPCQ9C0C6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CIPCQ9C0C6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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CIPCQ9C0C6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CIPCQ9C0C6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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