Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNDC1Q96C34 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms