Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RASSF3Q86WH2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms