Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC93Q567U6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms