Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 POC5-213ENST00000514838 1984 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZWINT-204ENST00000395405 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GPR82-201ENST00000302548 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PPP3CB-203ENST00000394828 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC061975.1-201ENST00000564762 2736 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DDI1-201ENST00000302259 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms