Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC96Q2M329 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms