Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL1Q13616 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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