Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF4Q08170 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms