Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSPL2Q05D32 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms