Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CHRNEQ04844 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CHRNEQ04844 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms