Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 THAP5-201ENST00000313516 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-202ENST00000425799 611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC096659.1-201ENST00000456728 549 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 UBE2E1-206ENST00000467766 585 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL157359.3-201ENST00000623771 217 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PDPN-210ENST00000513143 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 C2orf76-204ENST00000409877 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LINC01304-203ENST00000453880 812 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC084879.1-203ENST00000550470 1257 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC009654.1-201ENST00000560503 757 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC010542.2-201ENST00000568560 511 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AP001021.2-201ENST00000577935 544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms