Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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EFNB1P98172 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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EFNB1P98172 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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EFNB1P98172 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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EFNB1P98172 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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EFNB1P98172 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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EFNB1P98172 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
EFNB1P98172 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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