Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms