Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIRAP54198 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIRAP54198 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIRAP54198 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIRAP54198 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms