Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP53609 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms