Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms