Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCLMP48507 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms