Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BRAFP15056 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRAFP15056 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms