Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJB6O95452 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms