Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PFDN6O15212 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PFDN6O15212 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PFDN6O15212 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN6O15212 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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