Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
XIRP2A4UGR9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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