Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
UTP11Q9Y3A2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms