Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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COPS3Q9UNS2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
COPS3Q9UNS2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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