Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TSKSQ9UJT2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSKSQ9UJT2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms