Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ZNF275Q9NSD4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms